自然资源部东南生态脆弱区监测修复工程技术创新中心，于2019年由自然资源部正式批准建设。主管单位为福建省自然资源厅，依托单位为福建省耕地保护中心、福建农林大学、闽江大学、福建省地质工程勘察院。

        中心紧紧围绕自然资源部门的国土综合整治和生态修复核心职责，针对我国东南山地丘陵区及海陆交界带生态系统的薄弱环节，以及区域经济发展中自然资源开发与保护难题和生态保护修复重点问题，开展南方崩岗生态治理、地质灾害监测与防治、海岸带（海岛）监测与修复、耕地保护与土地综合整治、生态脆弱区监测评价等研究。力争研发一批新技术、新材料、新工艺和新装备，推进研究成果的工程化开发、产业化示范、规模化应用。探索建立互利共赢的运行模式和管理机制，加强闽台合作交流，建成东南地区乃至国内先进水平的国土综合整治和生态保护修复工程技术创新和应用示范基地、技术与市场信息发布平台、工程技术人才培养高地。引领东南区域国土综合整治和生态修复的研究与应用，构筑东南生态安全屏障。